MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL03

Total Repeats: 291

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018743	A	6	6	8	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018743	TAAT	2	8	70	77	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018743	GGC	2	6	85	90	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018743	GAA	2	6	111	116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018743	T	6	6	3239	3244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018743	TAA	2	6	3247	3252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018743	ACA	2	6	3280	3285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018743	AAT	2	6	3320	3325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018743	T	7	7	6112	6118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018743	T	6	6	6134	6139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018743	TCT	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018743	AGA	2	6	6572	6577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018743	T	6	6	6653	6658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018743	CAAAA	2	10	6678	6687	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018743	TAA	2	6	6691	6696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018743	A	8	8	6718	6725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018743	AAACG	2	10	6752	6761	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018743	ATG	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018743	TCC	2	6	6787	6792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018743	GAT	2	6	6909	6914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018743	ATG	2	6	6976	6981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018743	GAAA	2	8	7032	7039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018743	CAA	3	9	7058	7066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018743	GAA	2	6	7077	7082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018743	TTG	2	6	7115	7120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018743	CAA	2	6	7156	7161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018743	TAC	2	6	7219	7224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018743	AGT	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018743	CAC	2	6	7301	7306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018743	TAT	2	6	7334	7339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018743	TCA	2	6	7422	7427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018743	TCA	2	6	7508	7513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018743	TCAT	2	8	7541	7548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018743	AAT	2	6	7553	7558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018743	TAAA	2	8	7567	7574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018743	AATT	2	8	7585	7592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018743	CAT	2	6	7760	7765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018743	ATA	2	6	7783	7788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018743	AAG	2	6	7840	7845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018743	AACTAC	2	12	7903	7914	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018743	GCC	2	6	7980	7985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018743	GCC	2	6	8001	8006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018743	TATCAA	2	12	8023	8034	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018743	CGA	2	6	8230	8235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018743	ACC	2	6	8265	8270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018743	ATT	2	6	8273	8278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018743	GTTT	2	8	8353	8360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018743	GCG	2	6	8363	8368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018743	ATC	2	6	8378	8383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018743	ATT	2	6	8423	8428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018743	GCT	2	6	8468	8473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018743	TTG	2	6	8492	8497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018743	ACC	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018743	AGG	2	6	8587	8592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018743	CAA	2	6	8632	8637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018743	TAG	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018743	TAT	2	6	8675	8680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018743	TTC	2	6	8699	8704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018743	A	6	6	8718	8723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018743	ATT	2	6	8764	8769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018743	TTA	2	6	8807	8812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018743	AAT	2	6	8842	8847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018743	GCT	2	6	8867	8872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018743	A	7	7	8915	8921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018743	TAG	2	6	8959	8964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018743	TCAT	2	8	9019	9026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018743	ACA	2	6	9027	9032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018743	CGA	2	6	9073	9078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018743	ATC	2	6	9106	9111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018743	A	7	7	9158	9164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018743	ATA	2	6	9300	9305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018743	CATC	2	8	9306	9313	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018743	A	6	6	9389	9394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018743	AGA	2	6	9418	9423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018743	TTG	2	6	9428	9433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018743	T	6	6	9491	9496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018743	TATT	2	8	9517	9524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018743	CGAC	2	8	9592	9599	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018743	ATT	2	6	9624	9629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018743	CAA	2	6	9728	9733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018743	AGA	2	6	9757	9762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018743	CAG	2	6	9861	9866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018743	TAT	2	6	9875	9880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018743	CT	3	6	9901	9906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018743	T	6	6	9929	9934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018743	ATT	2	6	9953	9958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018743	CGAC	2	8	9975	9982	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018743	TGA	2	6	10036	10041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018743	AAATT	2	10	10077	10086	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018743	T	6	6	11646	11651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018743	ACA	2	6	11660	11665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018743	AT	3	6	11669	11674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018743	T	7	7	11695	11701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018743	TAAA	2	8	11713	11720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018743	AAATT	2	10	11724	11733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018743	T	7	7	11741	11747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018743	TAGA	2	8	11771	11778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018743	ATT	2	6	11781	11786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018743	AAT	2	6	11805	11810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018743	T	6	6	11829	11834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018743	ATC	2	6	11840	11845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018743	ACTT	2	8	11848	11855	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018743	A	6	6	11926	11931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018743	TAC	2	6	11941	11946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018743	CGC	2	6	11947	11952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_018743	TGG	2	6	11986	11991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018743	ACAA	2	8	12017	12024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018743	TAT	2	6	12045	12050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018743	CCA	2	6	12843	12848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018743	GTAA	2	8	12946	12953	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018743	ACA	3	9	13059	13067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018743	ATA	2	6	13093	13098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018743	TAAAC	2	10	14869	14878	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018743	CCA	2	6	14935	14940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_018743	AAC	2	6	14996	15001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018743	CGAA	2	8	15124	15131	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018743	A	7	7	15273	15279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018743	ATA	2	6	15328	15333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018743	CATAA	2	10	15337	15346	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018743	CA	3	6	15348	15353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018743	AGC	2	6	15383	15388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018743	TGAG	2	8	15429	15436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018743	AAAG	2	8	15584	15591	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018743	ATT	2	6	15678	15683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018743	AT	3	6	15701	15706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018743	TAA	2	6	15773	15778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018743	A	6	6	15805	15810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018743	TA	3	6	15812	15817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018743	TAA	2	6	15841	15846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018743	TAA	2	6	15849	15854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018743	CAA	2	6	15855	15860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018743	TAAA	2	8	15862	15869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018743	A	6	6	15908	15913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018743	A	6	6	15923	15928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018743	GTT	2	6	17253	17258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018743	ATT	2	6	17304	17309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018743	T	7	7	17308	17314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018743	A	6	6	17315	17320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018743	CAG	2	6	18119	18124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018743	TAAAT	2	10	18172	18181	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018743	AT	3	6	18180	18185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018743	TAG	2	6	18681	18686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018743	GATT	2	8	18702	18709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018743	TTG	2	6	18721	18726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018743	A	6	6	18744	18749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018743	CTT	2	6	18767	18772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018743	TTAC	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018743	TGA	2	6	22739	22744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018743	ATT	2	6	22749	22754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018743	T	7	7	22783	22789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018743	TGAAT	2	10	22866	22875	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018743	AC	3	6	24347	24352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018743	TA	4	8	24437	24444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018743	T	6	6	24465	24470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018743	ATC	2	6	24476	24481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_018743	TTA	2	6	24494	24499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018743	TTG	2	6	24505	24510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_018743	ATT	2	6	24565	24570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018743	T	6	6	24569	24574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018743	CATTA	2	10	24580	24589	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_018743	TTA	2	6	24615	24620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_018743	TAT	2	6	31250	31255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_018743	TAT	2	6	31558	31563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_018743	ATT	2	6	49740	49745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_018743	A	8	8	49813	49820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_018743	T	8	8	49825	49832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_018743	T	6	6	58899	58904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_018743	TAA	2	6	58941	58946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.